Linux étant un système d'exploitation « façon Unix », être familiarisé avec les concepts fondamentaux d'Unix comme l'arborescence des répertoires Unix et les permissions sur les fichiers est essentiel. Heureusement, il existe beaucoup de tutoriels Unix en ligne, qui, réunis, couvrent tout ce qu'un utilisateur peut avoir besoin de connaître pour utiliser Linux. Je vous suggère de placer dans vos favoris les liens suivant comme une bibliothèque de références en ligne :
Guide Unix pour les débutants de l'École Polytechnique Fédérale de Lausanne
Abrégé Unix de l'École Nationale Supérieure des Télécommunications
The Command and Shell User's guide (en anglais) par Digital Equipment Corporation est un excellent guide pour les systèmes d'exploitation Unix. Rajoutez leur page d'index dans vos signets comme une référence.
UNIXhelp (en anglais) dispose de nombreux miroirs de par le monde. C'est un site utile pour les débutants.
Introduction to Unix (en anglais) contient un utile résumé des commandes Unix (en anglais) avec de brèves mais utiles explications des commandes Unix classiques.
Unix is a Four Letter Word... (en anglais) est aussi une ressource adaptée aux débutants.